一是工作方式创新化。发改、财政是专项资金项目的主管部门，承担对项目实施和资金管理使用情况进行跟踪管理、绩效评价的职责。为提高项目实地核查的成效，该局在项目核查阶段，采取“审计部门和主管部门联合核查”的工作模式，成立项目联合工作组，对专项资金扶持项目进行实地核查，不仅注重问题的发现和整改，还积极听取项目单位建议，帮助项目单位解决难题，切实发挥审计监督和服务一体的功能。
二是审计清单个性化。根据发改、财政在专项资金管理中的不同职责，为各单位量身定制“个性化审计清单”，设计了不同单位提供资料的内容和模板，既解决了被审计单位提供资料不清晰的难题，又在一定程度上提高了审计效率。
三是审计成果强转化。除了在审计过程中及时撰写审计信息对审计工作进行报道宣传外，还对审计中发现的新问题积极进行协调反馈，深入分析问题形成的原因，并从完善制度管理方面提出切合实际的建议，有效的帮助资金顺利拨付和项目监管实施，切实发挥资金的使用效益。